ОЦЕНКА ВНУТРИВИДОВОГО ГЕНЕТИЧЕСКОГО ПОЛИМОРФИЗМА ИНВАЗИВНЫХ ВИДОВ ТЛЕЙ НА ОСНОВЕ АНАЛИЗА НУКЛЕОТИДНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ МИТОХОНДРИАЛЬНЫХ И ЯДЕРНЫХ ГЕНОВ,
ПРЕДСТАВЛЕННЫХ В GENBANK И BOLD
Желенговская Е. Н. (УО МГПУ им. И. П. Шамякина, Мозырь)
Научный руководитель – М. М. Воробьева, ст. преподаватель
В настоящее время для изучения генетической структуры вида, оценки внутри видового и межвидового генетического полиморфизма, а также для построения филогенетических систем используются молекулярные маркеры. Они представляют собой короткие участки генома, которые облегчают молекулярно-генетический анализ конкретного признака. Поскольку корректная видовая диагностика, установление таксономического статуса «проблемных форм», структуры и закономерностей формирования комплексов видов с использованием современных молекулярно-генетических методов необходимы для лучшего понимания механизмов, обеспечивающих высокую экологическую пластичность тлей, а такого рода данные предоставляют возможность осуществлять контроль численности и распространения насекомых-фитофагов, мы оценили представленность нуклеотидных последовательностей в Международных генетических базах данных и уровень их внутривидового генетического полиморфизма для некоторых видов тлей, представляющих угрозу в качестве вредителей и переносчиков заболеваний сельскохозяйственных и иных возделываемых культур на территории Беларуси.
В качестве объектов исследования выбрано 7 видов тлей, принадлежащие к числу инвазивных видов на территории Мозырского Полесья, в частности, Aphis craccivora Koch, Aphis spiraecola Patch, Brachycaudus divaricatae Shap., Drepanosiphum platanoidis (Schr.), Panaphis juglandis Gz., Pemphigus spy r othecae Pass. и Phyllaphis fagi L. Нуклеотидные последовательности, находящиеся в открытом доступе в GenBank [1] и BOLD [2], были извлечены и проанализированы с помощью программного обеспечения MEGA 7 (Molecular Evolutionary Genetics Analysis).
|
|
|
Детальный анализ показал, что в Международных базах генетических базах данных нуклеотидных последовательностей содержатся записи, касающиеся видов тлей, принадлежащих к числу инвазивных в условиях нашей страны. В GenBank и BOLD более хорошо представлены последовательности гена COI для трех инвазивных видов тлей: A . craccivora, A . spiraecola,
D . platanoidis; гена СOII для одного из инвазивных видов тлей: Aphis craccivora; cytb для одного инвазивного вида тлей: A. craccivora.
Анализ последовательностей митохондриальных генов показал, что инвазивные виды тлей характеризуются внутривидовым генетическим полимофизмом. Кроме того, в последовательностях гена COI двух видов тлей фауны Беларуси, в частности P . juglandis и B . divaricatae, отмечены уникальные замены.
В GenBank более хорошо представлены последовательности гена EF1α для одного инвазивных видов тлей: B . divaricatae. Для двух видов тлей (P. spy r othecae и D . platanoidis) в GenBank до сих пор не депонированы нуклеотидные последовательности по этому гену. Анализ последовательностей гена EF1α показал, что инвазивные виды тлей характеризуются внутривидовым генетическим полимофизмом.
|
|
|
Таким образом, можно заключить, что в Международных генетических базах данных содержится информация о нуклеотидных последовательностях инвазивных видов тлей
на территории Беларуси, что дает возможность изучить генетическую изменчивость этих видов тлей для лучшего понимания механизмов, обеспечивающих их высокую экологическую пластичность,
а такого рода данные предоставляют возможность осуществлять контроль численности
и распространения насекомых-фитофагов.
Исследования выполнены при финансовой поддержке Белорусского республиканского фонда фундаментальных исследований (договор № Б18МВ-008).
Литература
1. GenBank Overview [Electronic resource] / GenBank Overview. – USA, 2017. – Mode of access: https://www.ncbi .nlm.nih.gov/genbank/. – Data of access: 05.02.2019.
2. BOLD Systems v4 [Электронный ресурс] / BOLD Systems v4. – Ontario, 2017. – Режим доступа: http:/www.barcodingl ife.org/index.php/TaxBrowser_Home. – Дата доступа: 05.02.2019.
Дата добавления: 2019-07-15; просмотров: 138; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!