Топологическая матрица расстояния для изониазида
(атомы водорода при расчете не учитываются)
| № атома i\j | 1 N | 2 C | 3 C | 4 C | 5 C | 6 C | 7 C | 8 O | 9 N | 10 N |
| 1 N | 0,143 | 0,571 | 1,241 | 1,911 | 1,241 | 0,571 | 2,911 | 3,286 | 3,768 | 4,503 |
| 2 C | 0,571 | 0 | 0,67 | 1,34 | 1,812 | 1,142 | 2,34 | 2,715 | 3,197 | 3,932 |
| 3 C | 1,241 | 0,67 | 0 | 0,67 | 1,34 | 1,812 | 1,67 | 2,045 | 2,527 | 3,262 |
| 4 C | 1,911 | 1,34 | 0,67 | 0 | 0,67 | 1,34 | 1 | 1,375 | 1,857 | 2,592 |
| 5 C | 1,241 | 1,812 | 1,34 | 0,67 | 0 | 0,67 | 1,67 | 2,045 | 2,527 | 3,262 |
| 6 C | 0,571 | 1,142 | 1,812 | 1,34 | 0,67 | 0 | 2,34 | 2,715 | 3,197 | 3,932 |
| 7 C | 2,911 | 2,34 | 1,67 | 1 | 1,67 | 2,34 | 0 | 0,375 | 0,857 | 1,592 |
| 8 O | 3,286 | 2,715 | 2,045 | 1,375 | 2,045 | 2,715 | 0,375 | 0,25 | 1,232 | 1,967 |
| 9 N | 3,768 | 3,197 | 2,527 | 1,857 | 2,527 | 3,197 | 0,857 | 1,232 | 0,143 | 0,735 |
| 10 N | 4,503 | 3,932 | 3,262 | 2,592 | 3,262 | 3,932 | 1,592 | 1,967 | 0,735 | 0,143 |
Расчет минимального расстояния между атомами С4 и С6: 0,67 (С4-С5) + 0,67 (С5-С6) = 1,34. Связи С-С - ароматические.
Индекс Винера W = ∑ Dii + ½ ∑ Dij (при i>j), равен:
W = (0,143 + 0 + 0 + 0 + 0 + 0 + 0 + 0,25 + 0,143 + 0,143) + ½ · (20,003 + 17,148 + 13,326 + 8,834 + 10,174 + 12,184 + 2,824 + 3,199 + 0,735) = 44,893
где Dii – диагональный, Dij – недиагональный элемент топологической матрицы.
ПРИМЕЧАНИЕ 1.
Значения Dij диагональных элементов топологической матрицы расстояния для наиболее распространенных атомов в органических соединениях.
|
|
|
| № | Элемент | Dii |
| 1 | Углерод | 0 |
| 2 | Азот | 0,143 |
| 3 | Кислород | 0,25 |
| 4 | Сера | 0,625 |
| 5 | Фтор | 0,333 |
| 6 | Хлор | 0,647 |
| 7 | Фосфор | 0,6 |
Значения параметра Рij для связей различных атомов, используемых при расчете недиагональных элементов топологической матрицы расстояния
| Тип связи | Р ij | Тип связи | Р ij |
| С – С | 1,0 | N – N | 0,735 |
| С = С | 0,5 | N = N | 0,368 |
| С ≡ С | 0,333 | C – F | 0,667 |
| С – С ароматическая | 0,67 | C – Cl | 0,353 |
| C – N | 0,857 | C – S | 0,375 |
| С = N | 0,429 | C = S | 0,187 |
| C – N ароматическая | 0,571 | S = O | 0,141 |
| С - О | 0,75 | S – N | 0,321 |
| C = O | 0,375 | O – N | 0,643 |
Примеры вопросов входного теста:
1. Для расчета топологического индекса Винера необходимо составить топологическую матрицу:
a) обхода
b) расстояния
c) смежности
2. Атомы этого элемента исключаются из расчета топологического индекса:
a) кислорода
b) азота
c) углерода
d) водорода
3. Выберите правильные утверждения :
a) топологический индекс является молекулярным дескриптором
b) размерность топологической матрицы зависит от числа связей
|
|
|
c) топологический граф основан на пространственном расположении атомов
d) индекс Винера является реберновзвешенным
e) биологическая активность зависит от химической формулы вещества
4. Для составления уравнения прямой линии регрессии необходимо рассчитать:
a) выборочный коэффициент регрессии
b) выборочный коэффициент корреляции
c) максимальную суточную дозу
5. Для оценки тесноты линейной корреляционной зависимости необходимо рассчитать:
a) выборочный коэффициент регрессии
b) выборочный коэффициент корреляции
c) максимальную суточную дозу
6. Значение диагонального элемента топологической матрицы расстояния зависит от:
a) типа химической связи между атомами
b) числа всех электронов в атоме
c) числа атомов в молекуле
Литература для подготовки к работе на занятии:
1.Токсикологическая химия: Учебник для вузов / Под ред. Т.В. Плетеневой. – М.: ГЭОТАР-Медиа, 2005. – С. 74-81.
2. Быков В.А., Попов П.И., Плетенева Т.В., Сыроешкин А.В. и др. Применение метода количественных корреляций струткруа-свойство для прогнозирования терапевтических характеристик на примере группы нестероидных противовоспалительных средств. – Химико-фармацевтический журнал. Т. 38.- №5. - 2004.- С.17-22.
|
|
|
Дата добавления: 2023-01-08; просмотров: 144; Мы поможем в написании вашей работы! |
Мы поможем в написании ваших работ!